Description	Gene markers	BRCA				ESCA				STAD
		None		Purity		None		Purity		None		Purity
		Cor	P	Cor	P	Cor	P	Cor	P	Cor	P	Cor	P
CD8⁺ T cell	CD8B	0.0670	0.0262	0.0629	0.0474	−0.2090	0.0043	−0.2523	**	−0.1320	0.0071	−0.1314	0.0104
T cell	CD3D	0.1411	***	0.1433	***	−0.0822	0.2662	−0.1553	0.0374	−0.0169	0.7321	−0.0458	0.3741
	CD3E	0.1354	***	0.1378	***	−0.0796	0.2813	−0.1566	0.0358	−0.0438	0.3734	−0.0796	0.1221
	CD2	0.1823	***	0.1911	***	−0.0954	0.1963	−0.1620	0.0298	−0.0143	0.7716	−0.0430	0.4042
B cell	CD19	0.1114	**	0.1061	**	−0.1218	0.0986	−0.1921	0.0098	−0.1008	0.0402	−0.1197	0.0198
B cell	CD79A	0.0993	0.0010	0.0929	0.0034	−0.1296	0.0788	−0.1996	0.0072	−0.0449	0.3621	−0.0775	0.1321
Monocyte	CD86	0.3261	***	0.3388	***	0.1881	0.0104	0.1348	0.0713	0.1766	**	0.1442	0.0049
Monocyte	CD115 (CSF1R)	0.1292	***	0.1246	**	0.1329	0.0714	0.0887	0.2364	0.0796	0.1052	0.0483	0.3484
TAM	CCL2	0.2955	***	0.2941	***	0.2009	0.0061	0.1664	***	0.1194	0.0149	0.0892	0.0830
	CD68	0.3696	***	0.3846	***	0.1596	0.0300	0.1294	***	0.1816	**	0.1570	0.0022
	IL10	0.3334	***	0.3457	***	0.2242	0.0022	0.1972	***	0.1405	0.0041	0.0939	0.0678
M1 Marcophage	INOS (NOS2)	0.2002	***	0.1912	***	−0.1455	0.0481	−0.1446	***	0.1398	0.0043	0.1396	0.0065
	IRF5	0.1114	**	0.1127	**	−0.0193	0.7946	−0.0515	0.4925	−0.0669	0.1740	−0.0760	0.1397
	PTGS2	0.0863	0.0042	0.0817	0.0100	0.3327	***	0.3050	***	0.3330	***	0.3124	***
M2 Marcophage	CD163	0.3431	***	0.3582	***	0.1310	0.0755	0.0862	0.2498	0.1650	**	0.1295	0.0116
	VISG4	0.2502	***	0.2605	***	0.0926	0.2101	0.0507	0.4992	0.1019	0.0379	0.0684	0.1837
	MS4A4A	0.2575	***	0.2712	***	0.0769	0.2981	0.0312	0.6773	0.0649	0.1871	0.0429	0.4048
Neutrophils	CCR7	0.0951	0.0016	0.0948	0.0028	−0.0800	0.2789	−0.1502	0.0441	−0.0168	0.7335	−0.0452	0.3798
Natural kill cell	KIR2DL1	0.1538	***	0.1546	***	−0.0530	0.4737	−0.0858	0.2522	0.0187	0.7033	0.0512	0.3200
	KIR2DL3	0.1621	***	0.1576	***	−0.0523	0.4793	−0.0638	0.3949	0.0304	0.5374	0.0580	0.2598
	KIR2DL4	0.2156	***	0.2160	***	−0.0688	0.3521	−0.1022	0.1720	0.1601	0.0011	0.1434	0.0052
	KIR3DL2	0.1214	**1	0.1255	**	−0.0183	0.8045	−0.0524	0.4844	−0.0163	0.7400	−0.0115	0.8238
	KIR3DL3	0.0890	0.0031	0.0917	0.0038	−0.0435	0.5562	−0.0549	0.4641	0.0582	0.2369	0.0847	0.0998
	KIR2DS4	0.1701	***	0.1744	***	0.0465	0.5294	0.0162	0.8296	0.0457	0.3529	0.0693	0.1782
Dendritic cell	HLA-DPB1	0.0541	0.0729	0.0371	0.2423	−0.0373	0.6143	−0.0999	0.1819	−0.0125	0.7995	−0.0451	0.3815
	HLA-DQB1	0.1394	***	0.1317	***	−0.1081	0.1429	−0.1588	0.0332	0.0751	0.1266	0.0572	0.2668
	HLA-DRA	0.1977	***	0.2054	***	−0.0474	0.5220	−0.1001	0.1811	0.0469	0.3406	0.0267	0.6049
	HLA-DPA1	0.1136	**	0.1071	**	−0.0518	0.4836	−0.1054	0.1592	0.0205	0.6767	−0.0043	0.9341
Th1	STAT4	0.1423	***	0.1485	***	0.0918	0.2138	0.0214	0.7754	−0.0223	0.6502	−0.0431	0.4028
	STAT1	0.3206	***	0.3236	***	0.0495	0.5036	0.0130	0.8626	0.0773	0.1159	0.0723	0.1599
	IFN-γ	0.2338	***	0.2368	***	0.0282	0.7030	−0.0218	0.7719	0.1110	0.0237	0.1006	0.0504
Th2	GATA3	−0.3224	***	−0.3265	***	0.0070	0.9250	−0.0407	0.5879	−0.1413	0.0039	−0.1449	0.0047
	STAT6	−0.2108	***	−0.2203	***	−0.0115	0.8761	−0.0058	0.9380	0.0082	0.8675	0.0083	0.8716
	STAT5A	−0.1037	**6	−0.1201	**	0.0488	0.5094	0.0167	0.8244	0.0370	0.4519	0.0397	0.4409
Tfh	BCL6	−0.0880	0.0035	−0.0987	0.0018	0.0279	0.7064	0.0100	0.8943	0.0353	0.4735	−**2	0.9974
Tfh	IL21	0.1499	***	0.1506	***	−0.0226	0.7603	−0.0743	0.3215	0.0307	0.5332	0.0137	0.7897
Th7	STAT3	0.0179	0.5523	0.0298	0.3472	0.0983	0.1831	0.0620	0.4083	0.0977	0.0467	0.0876	0.0887
Th7	IL17A	0.1467	***	0.1566	***	0.0768	0.2987	0.0816	0.2759	0.2263	***	0.1965	**
Treg	FOXP3	0.3249	***	0.3291	***	0.1025	0.1650	0.0592	0.4297	0.0589	0.2312	0.0611	0.2353
	CCR8	0.3699	***	0.3778	***	0.1196	0.1050	0.0825	0.2710	0.1119	0.0226	0.1097	0.0328
	STAT5B	−0.2111	***	−0.2098	***	−0.0054	0.9901	−0.0051	0.9457	−0.0335	0.4964	−0.0326	0.5270
	TGFβ	0.5370	***	0.5397	***	0.4375	***	0.4228	***	0.1930	**	0.1731	**
T cell exhaustion	CTLA4	0.2950	***	0.3073	***	0.0838	0.2570	0.0336	0.6543	0.0545	0.2676	0.0473	0.3581
	LAG3	0.2435	***	0.2369	***	0.0022	0.9762	−0.0412	0.5831	0.0309	0.5298	0.0131	0.7988
	GZMB	0.3106	***	0.3282	***	0.0107	0.8855	−0.0431	0.5652	0.1848	**	0.1666	0.0011