| PCR gag/pol | PCR env/Nested pol | PCR HLA/Nested gag | Nested env | RT-qPCR quantitative |
Reverse Transcription |
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| 50˚C/30min. |
Enzyme Activation |
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| 95˚C/10min. |
Initial Denaturation | 95˚C/9min. | 95˚C/9min. | 95˚C/9min. | 95˚C/9min. |
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Denaturation per cycle | 94˚C/1min. | 94˚C/1min. | 94˚C/1min. | 94˚C/1min. | 95˚C/15sec. |
Hybridation per cycle | 50˚C/1min. | 50˚C/1min. | 55˚C/1min. | 45˚C/1min. | 60˚C/1min. |
Elongation per cycle | 72˚C/1min. | 72˚C/1min. | 72˚C/1min. | 72˚C/1min. |
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Final Elongation | 72˚C/10min. | 72˚C/10min. | 72˚C/10min. | 72˚C/10min. |
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Hold (en ˚C) | 4 | 4 | 4 | 4 |
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Number of cycle | 40 | 35 | 30 | 30 | 50 |