SNP

Primer sequence (5’ to 3’)

Primer conc.

Melting Temp

Annealing Temp.

Expected products

Forward outer primer GTCATAGGTCAAACAGCTAGATATTGGGT

0.04 µM

63˚C

rs972283

Reverse outer primer TCTACAGGACCAACTCAAATTATGAGGT

0.04 µM

63˚C

60˚C

Common 437 bp

(A/G)

Forward inner primer (G allele) TCATTGTATACTTGGAAAAAATCCTACATG

0.16 µM

62˚C

G allele 221 bp

Reverse inner primer (A allele) TATGTAAAAATAAGTATGCGCCATGCCT

0.04 µM

65˚C

A allele 274 bp