MLSA | Percentage of Similarity (number of nucleotide differences) based on: | APN-000 | ||
secA1 (432 bp) | gyrB (482 bp) | 16S rRNA(~1434 bp) | ||
N. abscessus | 99.7% (5) N. abscessus DSM 44432T | 98.9% (5) N. abscessus DSM 44432T | 100% N. abscessus ATCC BAA 279T | 79 |
N. asteroides | 100% N. asteroides ATCC19247 | 100% N. asteroides ATCC19247 | 100% N. asteroides Geno I DSM43757 99.5% (8) N. asteroides Geno III DSM 43255 99.2% (11) N. asteroides Geno II DSM 43258 | 10, 11, 28, 31, SM25, SM26,SM30 |
N. asteroides | 97.2% (12) N. asteroides ATCC19247 | 98.9% (5) N. asteroides ATCC19247 | 100% N. asteroides Geno II DSM 43258 99.3% (10) N. asteroids Geno III DSM 43255 99.2% (11) N. asteroides Geno I DSM43757 | 12, 47, 48 |
N. asteroides | 97.9% (9) N. asteroides ATCC19247 | 98.5% (7) N. asteroides ATCC19247 | 100% N. asteroides Geno II DSM 43258 | 49, 71 |
N. cyriacigeorgica | 100% N. cyriacigeorgica DSM 44484 | 100% N. cyriacigeorgica DSM 44484 | 100% N. cyriacigeorgica Geno I DSM 44484 | 13, 15, 32, 39, 55 |
N. cyriacigeorgica | 97.9% (9) N. cyriacigeorgica DSM 44484 | 95.9% (20) N. cyriacigeorgica DSM | 99.9% (1)% N. cyriacigeorgica Geno I DSM 44484 | SM62 |
N. cyriacigeorgica | 99% (4) N. cyriacigeorgica DSM 44484 | 100% N. cyriacigeorgica DSM 44484 | 100% N. cyriacigeorgica Geno I DSM 44484 | 66, 77 |
N. cyriacigeorgica | 97.9% (9) N. cyriacigeorgica DSM 44484 | 95.9% (20) N. cyriacigeorgica DSM | 99.9% (1)% N. cyriacigeorgica Geno I DSM 44484 | 69 |
N. farcinica | 99.5% (2) N. farcinica ATCC 1318 | 99.4% (3) N. farcinica ATCC 1318 | 100% N. farcinica Geno II DSM 44562 99.9% (1) N. farcinica Geno I DSM 43665T | 9, 18 |
N. farcinica | 100% N. farcinica ATCC 1318 | 100% N. farcinica ATCC 1318 | 100% N. farcinica Geno I DSM 43665T 99.9% (1) N. farcinica Geno II DSM 44562 | 22, 25, 29, 52, 1390 |
N. wallacei | 100% N. wallacei ATCC 49873 | 100% N. wallacei ATCC 49873 | 100%N. wallacei ATCC 49873 | 24 |
N. wallacei | 99.7% (1) N. wallacei ATCC 49873 | 100% N. wallacei ATCC 49873 | 100%N. wallacei ATCC 49873 | 35 |
N. wallacei | 99% (4) N. wallacei ATCC 49873 | 99.4 (3) N. wallacei ATCC 49873 | 100%N. wallacei ATCC 49873 | 41 |
N. wallacei | 99 % (4) N. wallacei ATCC 49873 | 99.2% (3) N. wallacei ATCC 49873 | 100%N. wallacei ATCC 49873 | 43 |
N. wallacei | 99.7 % (1) N. wallacei ATCC 49873 | 99.4 (3) N. wallacei ATCC 49873 | 100%N. wallacei ATCC 49873 | 53 |
N. wallacei | 100% N. wallacei ATCC 49873 | 99.2% (3) N. wallacei ATCC 49873 | 100%N. wallacei ATCC 49873 | 54 |
N. otitidiscaviarum | 100% N. otitidiscaviarum DSM 43242 | 100% N. otitidiscaviarum DSM 43242 | 100% N. otitidiscaviarum Geno I DSM 43242 | 7, 14, 16 |
N. nova | 99.3% (3) N. nova DSM 44481 | 99.6% (2) N. nova DSM 44481 | 99.7% (4) N. nova Geno I JCM 6044 | 23 |
N. nova | 99.3% (3) N. nova DSM 44481 | 99.6% (2) N. nova DSM 44481 | 99.6% (5) N. nova Geno V DSM 40806 | 51 |
N. kruczakiae | 100% N. kruczakiae ATCC BAA-948 | 100% N. kruczakiae ATCC BAA-948 | 100% N. kruczakiae ATCC BAA-948 | 80 |
N. carnea | 100% N. carnea DSM 44558, 97.9% (9) N. carnea ATCC 6847 | 100% N. carnea DSM 445589 97.9% (10) N. carnea IFM 0237 | 100% N. carnea Geno I DSM 43397 | 50 |
N. carnea | 100% N. carnea ATCC 6847 97.9% (9) N. carnea DSM 44558 | 100% N. carnea IFM 0237 | 100% N. carnea Geno III DSM 46071 | 40, 42 |
N. arthritidis | 100% N. arthritidis DSM 44731 | 100% N. arthritidis DSM 44731 | 99.9% (1) N. arthritidis IFM 10035T | 30 |
N. veterana | 100% N. veterana DSM 44445T | 100% N. veterana DSM 44445T | 100% N. veterana DSM 44445T | 78 |