Minimum number

Hydrophilic center

PM

AMBER

MP2/6-31G

9-methyladenine

1

N7

1.94

2.83

1.82

2.79

1.92

2.84

N6-H62

1.80

2.73

1.88

2.86

1.94

2.92

2

N6-H61

1.98

2.83

1.97

2.89

1.97

2.86

N1

1.88

2.77

1.83

2.79

2.01

2.90

3

N3

1.91

2.87

1.84

2.81

1.99

2.93

1-methyltimine

1

O4

1.88

2.83

1.70

2.08

1.97

2 .91

2

O4

1.96

2.79

1.76

2.69

1.94

2.80

N3-H3

1.86

2.75

2.11

3.06

1.93

2.83

3

O2

1.94

2.76

1.76

2.69

1.96

2.82

N3-H3

1.88

2.76

2.12

3.08

1.95

2.85

4

O2

1.87

2.83

1.69

2.67

1.95

2.90

9-methylguanine

1

N7

1.91

2.80

2.01

2.94

2.16

3.04

O6

1.91

2.77

1.88

2.78

2.16

3.05

2

N1-H1

1.84

2.76

2.00

2.69

1.89

2.81

O6

1.92

2.74

1.79

2.72

1.90

2.79

3

N1-H1

1.91

2.76

2.03

2.96

2.43

3.25

N2-H21

1.88

2.76

2.07

2.97

1.94

2.92

4

N2-H22

1.86

2.78

1.96

2.88

1.94

2.83

N3

1.98

2.80

1.85

2.80

1.98

2.83

1-methylcitosine

1

N4-H42

1.78

2.78

1.88

2.89

2.00

2.99

2

N4-H41

1.91

2.81

1.98

2.90

1.96

2.88

N3

1.93

2.79

1.86

2.79

1.96

2.83

3

N3

1.99

2.82

1.84

2.82

2.13

3.03

O2

1.96

2.68

2.55

3.00

2.31

3.02

4

O2

1.8

2.82

1.67

2.66

1.92

2.85