DNA duplex (5’→3’/3’→5’)*

Tm,

˚C (±1)**

h260,

% (±1)**

Kd,

nM

Kd ratio (oxidized/

unmodified)

Relative

methylation

rate***

VIII

GCTGCCACCCTGGGTCTAAC

CGACGGTGGGACCCAGATTG

75

14

30 ± 4

?

1.0

IX

GCTGCCACCCTgGGGTCTAAC

CGACGGTGGGA-CCCAGATTG

67

12

86 ± 7

2.9

0.18

X

TTGGTTTTAGGACAATTTGTCCTGTTTTGAT

AACCAAAATCCTGTTAAACAGGACAAAACTA

72

13

197 ± 20

?

?

XI

TTGGTTTTAGGACAATTTGTgCCTGTTTTGAT

AACCAAAATCCTGTTAAACA-GGACAAAACTA

60

16

374 ± 32

1.9

?

XII

TTGGTTTTAGGA-CAATTTGTCCTGTTTTGAT

AACCAAAATCCTgGTTAAACAGGACAAAACTA

62

15

363 ± 25

1.8

?

XIII

TTGGTTTTAGGA-CAATTTGTgCCTGTTTTGAT

AACCAAAATCCTgGTTAAACA-GGACAAAACTA

49

18

>4000

>20

?